Als Clary en Simon op een avond naar de pandemonium club gaan weet ze niet wat haar te wachten staat als ze 3 getatoeëerde jongeren een jongen ziet vermoorden, en om het nog raarder te maken kan alleen zij het zien.

Niet veel later verdwijnt haar moeder ook nog eens, en komt ze er achter dat zij zelf een schaduwjager is.

Ze gaat samen met Jace (een van de getatoeëerde jongeren) uitzoeken wat er aan de hand is en zo komt ze er achter dat ze zelf een schaduwjager is en ieder jaar een geheugenslot krijgt van de hoge heksenmeester van Brooklyn Magnus Bane.

Haar moeder blijkt vroeger de vrouw van de grootste schurk van de schaduwwereld te zijn geweest: Valentijn.

Ze gaat met Jace uitzoeken wat er met die Valentijn aan de hand is, en komen er achter dat hij de levensbeker wil dus ze willen hem voor zijn en halen hem eerder, maar Hodge de mentor van Jace blijkt een afspraak met Valentijn te hebben.

Jace en de levensbeker worden mee genomen door Valentijn naar Renwick (een oud ziekenhuis), Clary gaat daar samen met Luke (haar ‘oom’) naartoe, en  komt er achter dat Valentijn haar vader is en Jace Wayland die eigenlijk Jonathan Christopher Morgenstern blijkt te heten haar broer is, en zij niet Clary Fray maar Clary Morgenstern heet.

Jace wist zelf ook niet dat hij Jonathan heet, omdat Valentijn hem liet denken dat hij Jace was zodat als hij een zelfmoord in scene zou zetten de Lightwoods hem verder zouden opvoeden.